孔氏历代修谱都非常严格，明天启年间修谱规定义子不能入谱，违者重究。清康熙时修谱，规定更加详细：

一，凡不孝、不悌、犯义、僧道、邪巫、优卒、贱役等，都被认为是

“辱祖玷宗，丧名败节，皆不准入谱”；

二，因修谱都是集资，所以规定族人每丁交银八分，违者不准入谱；

三，孔氏子孙不仅行辈字有一定规定，即使用字亦随行辈而定，不准乱用。

修谱时，如有不依规定乱取用者，必须改正，否则不得入谱。乾隆甲子修谱除继承康熙时的规定外，又提出凡“养异姓为子、赘婿冒姓、子随母嫁携来同居”者，亦不得入谱。对以上各方面，不仅各户头要认真作保证，而且还发动族人知情者履行检举之责。

在孔氏宗族中，除大宗主衍圣公主持纂修的全谱外，各户、各支派还有自己纂修的小谱或支谱。这些谱牒各具特色，保存了大量珍贵的历史资料。比如，《林前户支谱》记载了从汉至清历代皇帝对孔氏优免赋役的敕文，并收入嘉庆年间立于孔庙毓粹门下的蠲免碑文。《大宗支谱》则收入了更为详细的资料，在人名之下不仅载有字号、功名官职，还有妻妾娶自何家、其子娶何家之女、其女嫁与何家之男等内容。由于支谱所刊印数量较少，留存下来的仅有八部，它们是：《东家小谱》、《嫡系小谱》、《续修支谱》二种，《大宗支谱》二种，《林前户支谱》、《林前户重修孔子世家谱》。

凡是流寓外地的孔氏族人纂修的支谱，必须获得衍圣公的批准，加盖衍圣公府大印后才能成立。各级官府主要根据衍圣公府钤印的有无，来判断内孔与外孔，决定是否给予优免差徭及有别于齐民的特权。

孔孟后人自明朝初起开始使用由中央政府颁布的字取名，并区分家族内部辈份。

明建文二年，惠帝赐孔氏八字行辈：“公、彦、承、弘、闻、贞、尚、胤”，以供取名。由于56代及57代衍圣公孔希学及孔讷先后于明洪武时袭封，所以“希”“言”亦用他行辈，排在“公”前。明崇祯元年，原行辈已经不够用，经65代衍圣公孔胤植奏准续十字，取名行辈：“兴毓传继广，昭宪庆繁祥”，而据《阙里志》载，此十字行辈亦连同十个表字辈：“起钟振体京，显法泽羽瑞”。

而“弘”字避清高宗讳改为“宏”；“胤”字避清世宗讳改为“衍”，又有改为“荫”、“允”、“坛”，但较少见。清同治二年，75代衍圣公孔祥珂袭封时因原有行辈经已用尽，故奏准新立行辈为：“令德维垂佑，钦绍念显扬”。

民国八年，76代衍圣公孔令贻又曾拟二十行辈，但未及上呈而逝世。民国九年十月由其遗孀陶夫人召集合族，议定先公所拟二十行辈，咨请北洋政府内政部核准公布。新拟行辈为：“建道敦安定，懋修肈懿长，裕文焕景瑞，永锡世绪昌”。有文献将“懿”字改成“彝”，“长”字改成“常”，“绪”字改成“续”。

另外，民国四年，袁世凯称帝，赐孔、孟、颜、曾四裔十字行辈：“鼎新开国运，克复振家声”，但此不为四裔后代所承认。

孔子后裔自56代起至于105代行辈如下：“希言公彦承，宏闻贞尚衍，兴毓传继广，昭宪庆繁祥，令德维垂佑，钦绍念显扬，建道敦安定，懋修肈懿长，裕文焕景瑞，永锡世绪昌”。

自此，用于孔子家族的辈份排定的字数共计50个。不少孔孟后人从名字上就能看出来辈分大小。在此之前，孔子家谱非常繁芜，这个取字方法比先前大大简化，又经皇帝提倡，使得其他大家族谱系的也开始效仿这种方法。

《孔子世家谱》续修工作协会会长、孔子第77代孙孔德墉曾对外介绍说，受国际儒学联合会的委托，1998年孔子的后人在香港注册了《孔子世家谱》续修工作协会，开始收集族人资料，进行《孔子世家谱》的第五次修订，协会已在世界各地建立了450多个续修机构，至今已收到世界各地120多万份孔子后裔的资料，证实孔子后裔繁衍到83代，辈分最小的是“念”字辈的一名十多岁的小女孩，在中国辽宁省。

由于孔氏谱系的完善，有时孔姓人也会遇到了一些小小的不便之处。如若按孔氏家规规定，同姓同宗晚辈见到长辈一定要按辈份称呼，往往出现年龄相仿者辈分相差数辈甚至十数辈的情形。另衍圣公府里面不用孔姓为佣人，主要原因就是衍圣公很可能比多数同宗人辈份要低，导致主仆关系和辈分关系发生尴尬。一些孔姓贫穷人家可能会先改名姓再进府为仆。

孟、曾、闵、冉（伯牛）、冉（仲弓）、端木、仲、言、卜、颛孙、有、东野等孔子弟子或其他先贤之后亦用孔姓行辈排序，唯开始时期和严格程度各有差异。唯有颜氏，因与孔子有亲缘（孔子母亲颜征在），另用字派。

他们的祖先都有一定的联系。一提到孔姓，我们一定最先想到的就是孔子。孔、颜、孟、曾这四个大姓都是与圣人有关。这四个姓的祖先分别指孔子，颜子，曾子与孟子，他们都是圣人。其中孔子是首圣。颜子是复圣，曾子是宗圣，孟子是亚圣。这四位圣人之间孔子是颜子和曾子的老师。孟子又是孔子的孙子的学生。我们也常常说，孔颜曾孟是一家。一日为师，终身为父，师出同门他们四大家共用一个通谱，所以他们会出现在一个族谱上面。孔子是名丘，字仲尼，是春秋时期的鲁国人。孔子是百家争鸣时鲁家学派的代表，他的弟子有着上千人其中著名的弟子颜渊就是颜子，曾参就是曾子。

这种不同姓氏的人出现在一个族谱的情况叫做通谱。一般是由皇帝封赐的，在朱元璋做皇帝的时候，他给孔家钦定了谱系。其实不只是孟、颜、孟、曾这三个姓，他还与卜、冉、闵这三个姓共用的一个谱系，这是在清朝乾隆时期一位孔家钦定的续谱。孔子对中国文化的影响重大且深远的。各代皇帝都十分尊重儒学。据记载，汉代的汉高祖刘邦、唐代的李隆基到宋朝的宋真宗赵恒再到清朝的康熙皇帝都亲自去祭祀过孔子。

孔子是儒学大家十分注重伦理秩序，这又是由皇帝钦定的族谱，孔家也被称为按资论辈最讲究的家族。他们取名字要严格按照你的辈分，且按伦理来说，这四家还不能通婚。因为同姓不通婚，虽然这四家不同姓但通用一个族谱，如果通婚还是有悖于家族伦理的。虽然说这一套在现代可能不太适用 ，但在古代是要严格遵守的，不知道因为这个在古代又拆散了几对好姻缘呢。