秦氏主源出自赢姓，相传系秦三世子婴后人，以国为氏；又一支出于姬姓，居秦邑，以邑为氏；另一支出于楚，古代称之三秦。上海和长江三角洲地区秦姓，大多源自高邮秦观家族，宋靖康之乱时，南居扬州和苏南；咸淳年间，秦知柔兄弟由扬州南渡，分居沪读、浦东九团、青浦赵屯。秦知柔孙就是秦裕伯。在此前后，同族秦约从盐城迁崇明，秦君瑞迁紫堤、幡龙，秦辅之从无锡迁嘉定。

各支秦姓字行辈份排列有序。清光绪十四年秦振生修<秦氏家谱> ，陕西省户县秦姓一支派语字行为：“德富乐顺，树圣祥荣，振春承宗”。1920年秦启泰等修《秦氏族谱》，湖北随州秦姓一支派语字行为“明信舒淳英，铭启胜乾贵。”

在我国的秦姓主要划分为两支，分别为西北的一支和东部及东南部的一支。前一支为颛顼赢姓的后代，发源地是甘肃省天水的故秦地。自秦朝灭亡以后，其公族便以国名为姓氏，其后裔多居于陕西等地。后一支则为黄帝姬姓的后代，其发源地在今河南范县及山东曲阜一带，后来发展成为我国秦姓繁衍的主流，而且其从一开始就向陕西省境内及湖北省播迁。

得姓始祖：伯益

颛顼帝有个孙女叫女修，她因吃燕子蛋而怀孕生下儿子大业。大业的儿子伯益因辅佐大禹治水有功，帝舜赐他嬴姓，并把本族姚姓子女嫁给他为妻。伯益的后人非子以善于畜牧而出名，他为周孝王养育良种马，深得孝王欢心，就封他在陇西秦亭(今甘肃张家川)为附庸国，让他恢复嬴姓，称为秦嬴。战国时，秦孝公任用商鞅变法，国力逐渐富强。公元前221年，秦王嬴政攻灭六国，统一天下，建立了中国历史上第一个封建王朝。公元前206年，秦朝灭亡，其王族子孙遂以国名为姓，称为秦姓。伯益从而也就成了秦姓的得姓始祖。

秦朝末年秦始皇的儿子胡亥和扶苏的部分子孙迁居到朝鲜，后来他们再由朝鲜迁到日本，此时他们已改姓“秦”。到日本的初期他们中有人掌管日本朝廷的出纳工作并且为天皇养蚕织绢，天皇赐姓、叫其中一部分人改姓“太秦公”。雄略天皇执政时期（公元456-479年），姓秦的秦始皇的后代在当时日本京城的人口中占了92部，总共18670人，到日本钦明元年（公元540年）时在京都繁衍到了7053户、35000人左右。现在日本京都附近的太秦就是日本秦氏的初居地。到九世纪时，日本秦氏已分支成太秦公、秦、秦冠、河内秦、山城秦等15个姓氏，到现在，日本秦氏已分化出总共44个姓。明治维新时日本政府要求所有的日本人都必须有姓（此前很多的日本百姓没有姓、没有学名大名、只有小名）并且强迫部分秦始皇的后代改姓羽田、波多等姓，京都的秦氏家庙（祠堂）及有关的历史文献遭到破坏（家谱就是一种历史文献）。

下面我列举一部分日本秦氏后人所拥有的姓：

秦内、太秦公（秦始皇三世孙 孝武王的后代，日本天皇先后赐封秦始皇的后代中的几个人为孝武王、男功满王、男融通王……）、秦公（姓这个姓的人是秦始皇帝孙“孝德王”的后代）、秦长连、秦野、秦井、秦多、秦当、秦佐、秦冠、秦前、秦党、秦原、秦小宅、已智、三林、长冈、……

秦氏后人中在日本比较著名的有：

1、秦野章（姓“秦野”）：80年代初中曾根任首相时他任法务大臣；

2、秦真次：昭和时期（就是裕仁当天皇时）曾当过陆军中将，福冈县人。

3、秦朝元：恒武天皇时的重臣 藤原种继的岳父，权倾朝野