（1）由实验2的F1自交，F2表现为12白：3黄：1绿，可判断南瓜皮色遗传遵循基因自由组合定律．

（2）由实验2的F1自交，F2表现为12白：3黄：1绿，可知，F1的基因型为HhYy，绿色基因型为hhyy，故h为控制酶1合成的基因．实验2的白甲×黄，F1表现为白，故白甲和黄的基因型为HHyy或hhYY，白色个体不能合成任何色素，白甲基因型为HHyy，**个体基因型为hhYY，故Y为控制酶2合成的基因．

（3）实验3白乙基因型为HHYY，绿色个体基因型为hhyy，白乙×绿，F1基因型为HhYy，表现为白，F1×绿（回交），得到的F2白色植株的基因型为HhYy和Hhyy，比例为1：1．因此HhYy植株自交，F3中花色的表现型及比例是12白：3黄：1绿；Hhyy植株自交，F3中花色的表现型及比例是3白：1绿=12白：4绿．因此，实验3得到的F2白色植株自交，F3中花色的表现型及比例是白色：黄：绿=24：3：5．

（4）据图分析，a处基因突变只导致一个氨基酸改变，这种突变可能是碱基对的替换，而b处突变导致b处及其后肽链上所有氨基酸都发生变化，可能是碱基对的增添或缺失．失活酶1的相对分子质量明显小于正常酶1，说明其肽链比正常的要短，可能为翻译提前终止．

故答案为：

（1）遵循      （2）HHyy

（3）白：黄：绿=24：3：5

（4）①替换    ②增添或缺失    提前终止

A：有可能乙是甲的后代啊。甲是Vv自交后代是VV或者Vv或者vv。这又有长翅也有残翅。

B：长翅与残翅交配，那么后代的基因型可能是Vv或者vv。而甲中全是长翅。所以不能证明

C：长翅互交。后代可能是VV。vv这不能能证明甲是乙后代。

D：甲中长翅可能是VV或者Vv。乙中长翅也可能可能是VV或者Vv。后代中三种基因型都有。这说明不了什么问题啊。