孔姓在自孔子之后的两千多年里，族属繁衍日众，遍及全国各州府县。为了使族属代代不乱，长幼有序，老少尊卑各有条理，孔氏宗族逐渐形成了一套严格的规范条例。

在明代以前，孔氏后裔没有固定的行辈，那时人数尚少，各家取名很随意。从四十五代起，已注意订定行辈，但还不严格，同辈人多采用同一偏旁或同一字作行辈字。明代初年，太祖朱元璋先后赐给孔氏十字作为行辈字，从五十六代起排，此后孔氏族人不准随便取名。衍圣公府还专门颁布了《孔氏行辈告示》：“……今依所定吉字开列于后，凡我族人俱当遵照所开列行辈，取名训字。有不钦依世次随意妄呼者，不准入谱。”明崇祯年间，六十五代衍圣公孔胤植报请皇帝，又立十字十辈。清同治年间，七十五代衍圣公孔祥珂经皇帝核准，又立十字十辈。1919年，七十六代衍圣公孔令贻由中华民国内务部备案续立二十字二十辈。以上几次订定的行辈字计五十字五十辈，为五十六代到一百零五代，依次为：

希言公彦承弘(宏)闻贞尚胤(衍)

兴毓传继广 昭宪庆繁祥

令德维垂佑 钦绍念显扬

建道敦安定 懋修肇彝常

裕文焕景瑞 永锡世绪昌

以上第六十五代本为“胤”字，衍圣公孔胤植为避皇帝庙讳，而将“胤”字改为“衍”字。 到20世纪90年代，曲阜当地的孔氏已传至八十代“佑”字辈，以下尚有25字可续。

曲阜衍圣公府的历代衍圣公，是孔子嫡系后裔中的长子长孙，长子是诸兄弟中的老大，往往是长子已经结婚生子，而幼子却是年龄很小的孩童，长此以往，同辈之间的年龄距离越拉越远。从孔子算起到20世纪40年代，二千余年中，在曲阜的孔氏族人上下已相差到12代之多，当时辈份最大的是六十六代的“兴”字辈，最小的是孔子嫡裔孔德成之子孔维益，为七十八代。到 90年代，在曲阜孔氏族人中上下相差11代，最大的是六十九代的“继”字辈，最小的是八十代的“佑”字辈。因此，孔姓中人见面，有时不好称呼，因为按孔氏家规规定，同姓同宗不能乱称，晚辈见到长辈一定要按辈份来称呼。衍圣公府里面不用孔姓为佣人，主要的原因就是衍圣公往往比大多数同里同宗穷人辈份要低几辈，面对面时虽是主仆关系，但依家规又应按辈份称呼，彼此都易尴尬。但实际上，由于衍圣公府里做活待遇高，可以养家糊口，一些孔姓贫穷人家便改名换姓进府为奴，改姓一般是改成母姓。

据《史记·孔子世家》记载，孔子的祖先本是殷商王室后裔。

周灭商后，周成王封商纣王的庶兄、商朝忠正的名臣微子启于宋， 建都商丘(今河南商丘一带)。

微子启死后，其弟微仲(一作微仲衍)即位，微仲即为孔子的嫡系先祖。孔子的六代祖叫孔父嘉，是宋国的一位大夫，做过大司马，在宫廷内乱中被杀，自孔父嘉之后，其后代子孙开始以孔为姓。其曾祖父孔防叔为了逃避宋国内乱，从宋国逃到了鲁国。从此孔氏在陬邑(今山东省曲阜市)定居，变成了鲁国人。

孔子的父亲为叔梁纥[叔梁为字，纥(he)为名]，母亲是颜徵在。叔梁纥是当时鲁国有名的武士，人品出众，建立过两次战功，因曾单臂托住悬门让冲进城池的部队撤出而闻名。曾任陬邑大夫。叔梁纥先娶妻施氏，生9女，无子；又娶妾，生一子，取名伯尼，即孟皮。孟皮脚有毛病，依当时礼仪不宜继嗣，于是又与年轻女子颜徵在野合而生孔子。

公元前551年(鲁襄公二十二年)，孔子生于鲁国陬邑昌平乡(今山东曲阜城东南)。因父母曾为生子而祷于尼丘山，故名丘，字仲尼。孔子三岁时，叔梁纥卒，孔子母子也不为叔梁纥的正妻施氏所容，孔母颜徵在只好携孔子及孟皮移居曲阜阙里，生活艰难。孔子17岁时，孔母颜徵在卒，他服了三年丧。

孔子十九岁时娶宋国人丌官氏之女为妻，一年后丌官氏生子，鲁昭公曾派人送鲤鱼表示祝贺，孔子感到十分荣幸，故给儿子取名为鲤(孔鲤)，字伯鱼。鲁哀公十年(公元前485年)，孔子夫人丌官氏去世。

据《孔子家语》和《史记》记载，孔子青年时代曾做过“委吏”(管理仓库的小官)、“乘田”(管理牧场的小官)，事无大小，均能做到近乎完美。由于孔子超凡的能力和学识，很快得到不断提拔。

到孔子五十一岁的时候，被任命为中都宰(相当于市长)，政绩非常显著；一年后升任司空(相当于建设部长)，后又升任大司寇(相当于今天的公安局部局部长兼检查部长兼职最高人民法院院长)；五十六岁时，又升任代理宰相，兼管外交事务(由于孔子升迁过快，不符合当时官员晋升标准，因此为代理宰相)。孔子执政时，立即将扰乱政事的奸佞大臣少正卯杀掉，以严肃法纪，因而名动一时，由此可看出孔子不是后世某些人认为的迂腐不堪的学究，而是敢作敢为但不暴虎冯河的伟丈夫。孔子执政仅三个月，就使鲁国内政外交等各个方面就均大有起色，国家实力大增，百姓安居乐业，各守礼法，社会秩序非常好(史书上称“路不拾遗，夜不闭户”)，奸佞之人和刁民纷纷出逃；同时，孔子还通过外交手段，逼迫齐国将在战争中侵略鲁国的大片领地还给了鲁国。鲁定公12年，孔子为削弱三桓(季孙氏、叔孙氏、 孟孙氏三家世卿，因为是鲁桓公的三个孙子故称三桓，当时的鲁国政权实际掌握在他们手中，而三桓的一些家臣又在不同程度上控制着三桓)，采取了堕三都的措施(即拆毁三桓所建城堡)。

后来堕三都的行动未能最终成功，但对强公室起到了相当大的作用。孔子杰出的执政能力让齐国倍感威胁，于是于是为了挤走孔子，送了上120匹良马和80名女乐给鲁国诸侯。鲁国国君沉溺于此，连续三天没有上朝，到了祭祀之日，忘了分祭肉(这在那个时代是非常严重的事情)。孔子对鲁君大失所望，于是离开鲁国，开始周游列国。孔子先后去了卫、宋、曹、齐、陈、蔡、楚等国。孔子虽然在各国都受到了尊重，但由于孔子以仁为核心，以礼为秩序，要求和谐，爱惜民力的政治主张和当时诸侯追求的霸道格格不入，孔子始终未能得到重用从而实施自己的政治理想。孔子68岁回到鲁国，鲁国国君对孔子相当礼遇，但依旧没有重用孔子。

孔子的政治理想在当时无法得到实施，但孔子之伟大在于“知其不可行而行之”，他将自己的政治理想寄托于后世。孔子因而在回到鲁国之后停止了直接的政治活动，一面继续整理文化典籍，修订六经；一面广收弟子，大规模的开展文化教育事业，相传教授弟子3000余人，其中精通六艺的弟子有72人。

晚年，孔子的最得意弟子颜回不幸早逝，得意门生子路死于卫国内乱，儿子孔鲤亦早逝，孔子在“道不行”和这一连串的打击之下，笔者猜测孔子的身体健康受到了极大的损害，孔子于公元前479年农历二月十一日73岁时(72周岁)与世长辞。

孔子家谱正式订出行辈是在明朝：明初朱元璋赐孔氏八个辈字：公、彦、承、弘、闻、贞、尚、胤，供起名用。后因洪武元年五十五代孔希学及洪武十七年五十六代孔讷先后袭封衍圣公。这样就把“希”和“言”旁加上去为十个字，即：希、言、公、彦、承，弘、闻、贞、尚、胤(后清代为避帝讳，将弘改为宏，胤改为衍)。明崇祯年间，这十个字已不够用，由六十四代衍圣公孔胤植(孔衍植)奏准。后续十字即：“兴毓传继广，昭宪庆繁祥”；到清乾隆九年(1744年)，由礼部调查整理，报皇帝钦定，再添十字：“令德维垂佑，钦绍念显扬”，民国八年由七十五代衍圣公孔令贻又立二十个字咨请当时的北洋政府核准公布。亦即第八十六代至一百零五代。即“建道敦安定，懋修肈彝常，裕文焕景瑞，永锡世绪昌”。到现在为止已知最小辈是“钦”字辈。因此，不少孔孟后人从名字上就能看出来辈分大小。在此之前，孔子家谱非常繁芜，这个取字方法比先前大大简化，又经皇帝提倡，使得中国其它大家族谱系的也开始效仿这种方法。 由于孔氏谱系的完善，有时孔姓人也会遇到了一些小小的不便之处。如若按孔氏家规规定，同姓同宗晚辈见到长辈一定要按辈份称呼，往往出现年龄相仿者辈分相差数辈甚至十数辈的情形。另衍圣公府里面不用孔姓为佣人，主要原因就是衍圣公很可能比多数同宗人辈份要低，导致主仆关系和辈分关系发生尴尬。一些孔姓贫穷人家可能会先改名姓再进府为仆。 孟子、曾子、颜子三族亦用孔姓行辈排序，这三家的家谱与孔子家谱合称“通天家谱”，唯开始时期和严格程度各有差异。

　　家谱

　　- 卌七世祖 黄帝轩辕氏

　　- 卌六世祖 少昊金天氏(玄嚣)

　　- 卌五世祖 蟜极

　　- 卌四世祖 帝喾高辛氏

　　- 卌三世祖 契

　　- 卌二世祖 昭明

　　- 卌一世祖 相土

　　- 四十世祖 昌若

　　- 卅九世祖 曹圉

　　- 卅八世祖 冥

　　- 卅七世祖 振(王亥) 王恒

　　- 卅六世祖 上甲微

　　- 卅五世祖 报乙

　　- 卅四世祖 报丙

　　- 卅三世祖 报丁

　　- 卅二世祖 主壬

　　- 卅一世祖 主癸

　　- 三十世祖 商王成汤(太乙)

　　- 廿九世祖 太丁 商王外丙 商王仲壬

　　- 廿八世祖 商王太甲(太宗)

　　- 廿七世祖 商王沃丁 商王太庚

　　- 廿六世祖 商王小甲 商王雍己 商王太戊(中宗)

　　- 廿五世祖 商王仲丁 商王外壬 商王河亶甲

　　- 廿四世祖 商王祖乙

　　- 廿三世祖 商王祖辛 商王沃甲

　　- 廿二世祖 商王祖丁 商王南庚

　　- 廿一世祖 商王阳甲 商王盘庚 商王小辛 商王小乙

　　- 廿一世祖 商王武丁(高宗)

　　- 二十世祖 商王祖庚 商王祖甲

　　- 十九世祖 商王廪辛

　　- 十八世祖 商王康丁

　　- 十七世祖 商王武乙

　　- 十六世祖 商王文丁

　　- 十五世祖 商王帝乙

　　- 十四世祖 商王帝辛(纣) 微子 微仲衍

　　- 十三世祖 宋公稽

　　- 十二世祖 宋丁公申

　　- 十一世祖 宋闵公共

　　- 十世祖 弗父何

　　- 九世祖 宋父周

　　- 八世祖 世子胜

　　- 七世祖 正考父

　　- 六世祖 孔父嘉

　　- 五世祖 木金父

　　- 高祖 祁父

　　- 曾祖 防叔

　　- 祖父 伯夏

　　- 父 叔梁纥

　　- 孔子

　　- 子 孔鲤

　　- 孙 孔伋

　　- 曾孙 孔白

　　- 玄孙 孔求

　　- 六代孙 孔箕

　　- 七代孙 孔穿

　　- 八代孙 孔谦

　　- 九代孙 孔鲋、孔树、孔腾，汉高祖刘邦封孔腾为“奉祀君”

　　- 十代孙 孔忠

　　- 十一代孙 孔武

　　- 十二代孙 孔延年

　　- 十三代孙 孔霸，汉元帝封为“褒成侯”，赐食邑八百户。

　　- 十四代孙 孔福，被汉成帝绥和元年封为“殷绍嘉侯”

　　- 十五代孙 孔房，褒成侯

　　- 十六代孙 孔均，褒成侯

　　- 十七代孙 孔志，褒成侯

　　- 十八代孙 孔损，褒亭侯

　　- 十九代孙 孔曜，奉圣亭侯

　　- 二十代孙 孔完、孔赞，褒成侯

　　- 二十一代孙 孔羡，宗圣侯

　　- 二十二代孙 孔震，奉圣亭侯

　　- 二十三代孙 孔嶷，奉圣亭侯

　　- 二十四代孙 孔抚，奉圣亭侯

　　- 二十五代孙 孔懿，奉圣亭侯

　　- 二十六代孙 孔鲜，奉圣亭侯

　　- 二十七代孙 孔乘，崇圣大夫

　　- 二十八代孙 孔灵珍，崇圣侯

　　- 二十九代孙 孔文泰，崇圣侯

　　- 三十代孙 孔渠，崇圣侯

　　- 三十一代孙 孔长孙，恭圣侯

　　- 三十二代孙 孔嗣悊，绍圣侯

　　- 三十三代孙 孔德伦，褒圣侯

　　- 三十四代孙 孔崇基，褒圣侯

　　- 三十五代孙 孔璲之，褒圣侯、文宣王兼兖州长史

　　- 三十六代孙 孔萱，文宣公

　　- 三十七代孙 孔齐卿，文宣公

　　- 三十八代孙 孔惟晊，文宣公

　　- 三十九代孙 孔策，文宣公

　　- 四十代孙 孔振，文宣公

　　- 四十一代孙 孔昭俭，文宣公

　　- 四十二代孙 孔光嗣，泗水主簿

　　- 四十三代孙 孔仁玉，文宣公兼曲阜县令

　　- 四十四代孙 孔宜，文宣公兼曲阜主簿、赞善大夫

　　- 四十五代孙 孔延世，文宣公兼曲阜县令 历代衍圣公：

　　- 第46代衍圣公 孔圣佑，文宣公兼知县事、孔宗愿，

　　- 第47代衍圣公 孔若虚、孔若愚、孔若蒙

　　- 第48代衍圣公 孔端立、孔端操、孔端友(南宗)

　　- 第49代衍圣公 孔琥、孔璠、孔玠(南宗)

　　- 第50代衍圣公 孔拂、孔摠、孔晋、孔拯

　　- 第51代衍圣公 孔元用、孔元孝、孔文远(南宗)、孔元措、孔元紘

　　- 第52代衍圣公 孔之厚、孔之全、孔万春、孔之周

　　- 第53代衍圣公 孔浣、孔治、孔贞、孔洙(南宗)

　　- 第54代衍圣公 孔思晦、孔思诚、孔思许(南宗)

　　- 第55代衍圣公 孔克坚、孔克忠（南宗）

　　- 第56代衍圣公 孔希学、孔希路（南宗）

　　- 第57代衍圣公 孔讷、孔议（南宗）

　　- 第58代衍圣公 孔公鉴、孔公诚(南宗)

　　- 第59代衍圣公 孔彦缙、孔彦绳(南宗)

　　- 第60代衍圣公 孔承庆、孔承美(南宗)

　　- 第61代衍圣公 孔宏绪、孔宏泰（字永实）、孔弘章(南宗)

　　- 第62代衍圣公 孔闻韶、孔闻音(南宗)

　　- 第63代衍圣公 孔贞干、孔贞宁、孔贞运(南宗)

　　- 第64代衍圣公 孔尚贤、孔尚乾（南宗）

　　- 第65代衍圣公 孔衍植、孔衍桢（南宗）

　　- 第66代衍圣公 孔兴燮、孔兴燫(南宗)

　　- 第67代衍圣公 孔毓圻、孔毓垣（南宗）

　　- 第68代衍圣公 孔传铎、孔传锦(南宗)

　　- 第69代衍圣公 孔继濩、孔继涛(南宗)

　　- 第70代衍圣公 孔广棨、孔广杓(南宗)

　　- 第71代衍圣公 孔昭焕、孔昭烜(南宗)

　　- 第72代衍圣公 孔宪培、孔宪坤(南宗)

　　- 第73代衍圣公 孔庆鎔、孔庆仪(南宗)

　　- 第74代衍圣公 孔繁嘉、孔繁豪(南宗)

　　- 第75代衍圣公 孔祥壮、孔祥娜(南宗)

　　- 第76代衍圣公 孔令贻（字谷孙），1877年（光绪三年）5岁时承袭衍圣公

　　- 第77代衍圣公 孔德成(1920年—2008年)

　　- 第78代大成至圣先师奉祀官孔维益

　　- 第79代大成至圣先师奉祀官 孔垂长

　　- 第80代大成至圣先师奉祀官 孔佑仁