北宋元丰及明弘治年间所修的孔氏族谱，久已亡佚，今天能看到的只有天启、康熙、乾隆和民国所修的四部。从这四部族谱的纂修人员的设置来看，可以发现，随着世代推移，修谱机构的设置规模逐渐扩大。为确保修谱工作的顺利进行，衍圣公府建立了一整套严密的组织机构和人事安排，如乾隆九年(1744年)修谱时，设立鉴定一人，由衍圣公担任；监修二人，由三品执事官和世袭翰林院五经博士担任；提调二人，由正一品荫生候选员外郎和曲阜县世职知县担任；以下编次、掌收、校阅、誉录、督刊、收发等职，也是各由四品执事官、候选州同知之类有官职者及有科名的人员担任。到民国时期最后一次大修时，衍圣公孔德成主持，专门设立了“曲阜全国孔氏合族修谱办事处”(简称“谱馆”，古时称：“纂局”)，孔德成任总裁，由族长孔传蜻等三人主持日常工作，谱馆有职员66名，另有一些勤杂员役。修谱时，衍圣公府要先行制订条规、颁布榜示，制订统一格册和修谱誓词。然后择吉日举行仪式，告庙致祭后，各执事人员进入修谱的专设机构纂局内办公。族谱纂修完成，要在孔庙举行隆重的告祭仪式。各户族众按规定领到新谱后，即将旧谱交至族长，立即焚瘗。如有失落旧谱者，即声明，该户头户举出具证明，刻附谱后。

实际上，孔姓本身就是一个十分古老的姓氏，他们的祖先，可以远远地追溯到4400多年以前的帝喾高辛氏。帝喾是黄帝的孙子，曾经继黄帝及其父少昊之后，领导中华民族70年，因此孔姓的人，当然也是黄帝的后裔。

关于孔姓的来源，《广韵》上面有这样的记载：“殷汤之后，本自帝喾次妃兰狄吞乙卵生契，赐姓子氏；至成汤以其祖吞乙卵而生故名履，字太乙，后代以子加乙，始为孔氏。至宋孔父嘉，遭华父督之难，其子奔鲁，故孔子生于鲁。”

由此看来，孔姓是出自殷商的子姓，而殷商的开国之君殷汤，则是帝喾的次妃所生的儿子契的后代，殷汤为了纪念自己的祖先是吞乙卵而生，就取字为乙，传了若干代，到了春秋时代，在宋国的孔父嘉，为华督所杀，他的儿子就跑到鲁国避难，并且在鲁国定居，所以孔子才会是鲁国人。

《史记孔子世家》上面，对于孔姓的渊源，有更为详细的说明：“孔子，宋微子之后，宋襄公生弗父何，弗父何生宋父周，周生世子胜，胜生正考父，考父生孔父嘉，五世亲尽，别为公族，姓孔氏。孔父嘉生木金父，木金父生睾夷，睾夷生防叔，防叔畏华氏之逼，奔鲁。”

从这段记载，可以明显的看出，殷汤的后代以孔为姓，是始自孔父嘉。孔父嘉是春秋时代宋国的人，所以孔氏之得姓，应该也已经有了三千年的悠长历史。

《广韵》和《史记》上面对于孔姓的记载，内容大致相同，唯一的不同，是关于孔父嘉的后代奔鲁的记述：《广韵》上说，避华督之祸跑到鲁国的是孔父嘉的儿子木金父；《史记》上则说，奔鲁的是孔父嘉的孙子睾夷。实际上究竟是谁最先到鲁国开基，迄今仍众说纷纭，找不到确定的答案。

不过，无论哪一位才是鲁国孔氏的真正开山始祖，孔子之为孔父嘉的六世孙，已经是个不争之论。据考证，孔子的父亲是叔梁纥，祖父是伯夏，伯夏则是防叔之子。由此可见，孔父嘉不但是孔姓的创造人，而且的确是2000多年来举世同钦的至圣先师孔子的六世祖。

孔子以下的孔氏家谱，历2000余年如一日，把每一代子孙都记载得源源本本。因此，孔子的历代子孙究竟都做了些什么，各种史书上的记载也未曾间断过，而且交代得清清楚楚。 像这样，能够把孔氏的世系追溯得分毫不爽，岂不是孔姓的人比别姓的人幸运，而又足以自豪自傲的地方！孔，的的确确是一个尊荣无比的汉族姓氏。