官方：基因本体（GO）知识库是有关基因功能的全球最大信息来源。 这些知识既是人类可读的，也是机器可读的，并且是生物医学研究中大规模分子生物学和遗传学实验的计算分析的基础。

在读懂基因本体论（Gene Ontology）前，我们先看看什么是本体论：

本体论（Ontology ）是探究世界的本原或基质的哲学理论 。

本体论通常处理的问题：存在哪些本质，如何将这些本质分组，在层次结构内关联以及如何根据相似性和差异进行细分 。

基因本体论（Gene Ontology）包含生物学领域知识体系本质的表示形式，本体通常由一组类（或术语或概念）组成，它们之间具有关系。 基因本体论（GO）从三个方面（GO domains）描述了我们对生物学领域的了解：

理解了上述的概念，现在举个例子，如果站在基因本体论GO的角度来解释一个基因的话：

基因产物：细胞色素C（cytochrome c）

分子功能：氧化还原酶活性

细胞组分：线粒体基质

生物过程：氧化磷酸化

自定义同义词类型也用于本体中。 例如，许多同义词被指定为系统同义词。 此类型的同义词是术语名称的确切同义词。

GO以图的形式构建，术语作为同种的节点，术语间的关系（对象属性）作为连接。

GO图中的节点与其他节点可以具有任意数量和类型的关系， 就像层次结构，例如，家谱或一个物种的分类法

一个节点可能与多个子节点（更特定的节点）具有连接，也可以具有多个父节点（较宽的节点）

利用关系与关系间的连接可以推断相应的分组注释，节点间关系的推断，这个会在后面详细研究：

上图表示：A is a B，B is part of C，所以可以推断 A is part of C

节点间总体与部分关系：

一个节点可能与一个节点有一部分关系。 下图说明了这一点：

上图： mitochondrion 是两个节点的父节点：it is an organelle and it is part of the cytoplasm ； organelle 有两个子节点: mitochondrion is an organelle, and organelle membrane is part of organelle

我们将上面的关系图简化表示为 箭头导向性图 ，这是图中常见的关系表示：

接下我们详细看看GO是怎样来描述这几种关系的：

如果我们说 A is a B ，则意味着节点A是节点B的子类型。例如，有丝分裂细胞周期是细胞周期，或者裂解酶活性是催化活性。

应该注意的是，a并不代表是实例。 从本体论上来说，一个实例是某个事物的具体示例。 例如 猫是哺乳动物，但加菲猫是猫的实例，而不是猫的亚型。 GO中的术语表示实体或现象的类别，而不是特定的表现形式（或实例）。 但是，如果我们知道猫是哺乳动物，则可以说猫的每个实例都是哺乳动物。

使用 is a 对批注进行分组是 安全的 。例如，如果将基因产物X注释为具有酪氨酸激酶活性，并且本体论证明酪氨酸激酶活性是激酶活性的一种（类型），那么我们可以安全地得出结论，基因产物X具有激酶活性。

利用上面得到结论，我们可以将 is a 关系和其他关系类型结合来推断，下图表示了可以推断的关系：

关系的一部分用于表示整个部分的关系。 part of 只有当B一定是A的一部分时，才会在A和B之间部分关系：无论B存在于何处，它都是A的一部分，B的存在意味着A的存在。但是，考虑到A的出现，我们不能肯定地说B的存在。

使用的 part of 进行分组注释是 安全的 。 例如，如果将基因产物X标注为位于线粒体内膜上，而本体论记录了线粒体内膜与线粒体之间的关系的一部分，则可以安全地得出结论X位于线粒体内。

利用上面得到结论，我们可以将 part of 关系和其他关系类型结合来推断，下图表示了可以推断的关系：

has part 是对关系部分的逻辑补充，它从父级的角度代表了“部分-整体”关系。

与 part of 一样，GO关系 has part 仅在A始终将B作为一部分的情况下使用，即A必定具有B的部分。 但是，如果B存在，我们不能肯定地说A存在。 即所有A都有B部分，但是A只是B的一部分。

使用 has part 注释进行分组是 不正确的 。 例如，我们可以在本体论中断言受体酪氨酸激酶活性具有部分激酶活性。 然而，将所有注释归类到受体酪氨酸激酶活性下的激酶活性将是不正确的。

利用上面得到结论，我们可以将 has part 关系和其他关系类型结合来推断，下图表示了可以推断的关系：

一种过程直接影响另一种过程或质量的表现，即前者调节后者。 调节的目标可以是另一种过程，例如调节途径或酶促反应，或者可以是质量，例如细胞大小或pH。 与 part of 关系类似，该关系专门用于表示必定的调节：如果同时存在A和B，则B总是调节A，但是A可能不总是受B调节，即所有B都调节A; 一些A受B调节。

如果将基因产物X注释为参与调节糖酵解的过程，则不能得出结论X参与糖酵解是 不正确的 。 但是，某些工具使用调节关系来对批注进行分组, 这可用于基因集富集, 所得的基因集包括与分组术语有因果关系的过程中涉及的基因。

利用上面得到结论，我们可以将 regulates 关系和其他关系类型结合来推断，下图表示了可以推断的关系：

GO的结构可以用下图来表示，这个图也叫有向无环图（Directed Acyclic Graph ，DAG）。

如上图所示，三个GO域（细胞成分，生物学过程和分子功能）分别由一个单独的根本体术语表示。

一个域中的所有术语都可以将其父源追溯到一个根术语，通过到本体根的中间术语可能存在许多不同的路径。

这三个根节点是不相关的，并且没有公共的父节点，这意味着来自不同本体的术语之间没有任何关系。但是，GO本体之间也存在其他关系，例如，分子功能术语“细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性”是生物过程“细胞周期”的一部分。GO本体间相关 http://geneontologyorg/docs/ontology-relations/ 。

某些基于图的软件可能需要一个根节点。在这种情况下，可以将“假”术语添加为三个现有根节点的代。

GO只代表生物学的当前认知，因此随着生物学知识的积累，它会不断地被修订和扩展。也就是说目前的GO术语不一定代表某个基因产物所有的功能，组分或参加的过程，只是现阶段对它的认知。

每周更新一次，由GOC本体团队与请求更新的科学家共同完成的。

杜家族谱是杜氏家族的重要遗产，记录了杜家族谱的历史与传承。经过多年的努力，杜家族谱已经被完整地记录下来，并且得到了广泛的传承和保护。下面将介绍杜家族谱的历史、传承以及如何查阅杜家族谱。

杜家族谱的历史

杜家族谱是杜氏家族的重要文化遗产，它记录了杜氏家族的历史和发展。据传，杜氏家族起源于唐朝，当时的祖先是一位名叫杜伯康的人。杜伯康是一位勇猛善战的将领，他在唐朝的战争中表现出色，被封为“杜国公”。从此，他的后代就以“杜国公”为姓氏，形成了杜氏家族。

随着时间的推移，杜氏家族逐渐壮大，分布在各地。为了保持家族的联系和传承家族文化，杜氏家族开始编写家族谱。最早的杜家族谱可以追溯到明朝，但由于历史的变迁和战乱，很多家族谱都遗失了。直到清朝中期，杜氏家族开始重新编写家族谱，经过多年的努力，杜家族谱得到了完整的记录。

杜家族谱的传承

杜家族谱是杜氏家族的重要文化遗产，传承了家族的历史和文化。为了保护和传承家族谱，杜氏家族成立了杜氏家族谱保护协会。该协会负责家族谱的收集、整理、保护和传承工作。协会的成立得到了杜氏家族的广泛支持和参与。

杜氏家族谱保护协会采取了多种措施，保护和传承家族谱。首先，协会对家族谱进行了数字化处理，建立了家族谱数据库。其次，协会定期举办家族谱展览和文化活动，让更多的人了解杜氏家族的历史和文化。最后，协会还开设了家族谱研究课程，培养家族谱研究人才。

如何查阅杜家族谱

杜家族谱是杜氏家族的重要文化遗产，也是研究家族历史和文化的重要资料。如果您想查阅杜家族谱，可以采取以下步骤：

1了解杜氏家族谱保护协会的****，可以通过协会官网或者电话咨询。

2联系协会，了解家族谱的存放地点和查阅规定。一般来说，家族谱只允许在协会指定的地点查阅，而且需要遵守查阅规定。

3前往指定地点查阅家族谱。在查阅过程中，需要注意保护家族谱，不得损坏或带走家族谱。

4如果需要复制或拍照，需要得到协会的许可，并遵守相关规定。

很赞，利用互联网技术把所有百姓的家谱修到网上，建立大型的数据库。相对于时下单一姓氏的互联网修谱，“同心圆”家谱技术，将能开发出更多实用的功能和更具有实际商业价值的运用，对于将家谱文化与经济结合，将起到探索与实用的作用。

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保护隐私。中国家谱族谱数据库是中国农村研究院/政治科学高等研究院历时3年建设的数据库，已收录的电子化家谱族谱资料共17723册，120893卷，居全球第一，网站里设计到个人名字，地址等隐私。不能查阅。

首先，第一步是收集相关信息。

1祖先迁居前居住地的确切记录(族谱记载或口头流传，如果是迁居此地的官员，可以查地方志和史籍)

2始祖的姓名、字、号、秩数，始祖的生卒年月，以及相关的生平事迹和典故。(先迁祖籍的兄弟、父亲、祖父的姓名，是否同宗、同支)；

3、词派，排名词代；

4祖先的相关信息(祖先的其他间接信息，如哪个县，谁是本地人)；

5家族的迁徙历史(如迁徙年月，迁徙的故事和传闻)。

6现存家谱的祖先和年代。

第二，求根。第二步:如何收集寻根信息？

1查族谱如果有族谱的话，一般的族谱记载最清楚。

2如果没有族谱，查祖坟墓碑文字？，尤其是始祖的墓碑，大部分都能找到一些有价值的信息。

3如果没有族谱或碑文，只能询问族中老人，仔细记录他们口头的祖先地名、村名、祖名、人物、家乡风俗、故事传说等。尽可能多和老人交谈，用各种方式记录下这些珍贵的资料。

4查看家族是否保存了之前的土地和房产契约，可以大致查到始祖的名字和他生活的时代。

第三，求根。第三步:寻根信息的对接和确认。

寻根信物不是指某一具体物品，而是指家谱中记载的、口头流传下来的祖名、祖坟等寻根信息。通过网络交流，你可以认识到这些信息，并将它们与你的亲人联系起来。如果没有相似性，那么是同族的可能性很小，寻根信息越详细，寻根的可能性越大。至于始祖的地名，在不同的年代有不同的记载方式，比如多少个都城，什么州县等等。，可以根据大致地名所在的地方县志，找出详细准确的位置，再与今天的地图进行对比确认。也可以向当地人和朋友咨询。

四。寻根问祖第四步:寻根方式和实地调查。

尽可能丰富的收集这些东西，然后在网上寻找族人和姓氏，发布寻亲信息。也可以在当地论坛发帖，或者搜索加入当地qq群，入祖群，同部落群等。要和族人交流，或者在一些族谱数据库平台上搜索。在网上联系祖籍的宗族亲戚后，你应该从他那里知道祖籍的事情。当大量数据可以确认的时候，就可以去祖籍看看了。根据祖谱记载，查明是否有侨民，确认是否与祖籍资料相符。

希望对你有帮助~