临桂石氏原籍山东青州乐陵，相传为汉万石君石奋之后，大约在西晋永嘉之乱（311）时南徙。南宋王之望在《石延庆墓志铭》中记载临桂石氏来源时说：

　　永嘉之乱，曰举南渡，为建安太守；子孙散处吴越，或家于临桂。（《汉滨集》卷十五）

　　这一说法虽然简略，却颇有代表性，与明成化《临桂县志》和现存石氏宗谱的记载基本一致，只是后者的南徙时间是在西晋建兴末年（317），晚了几年。在石氏南徙时间上，亦有颇为不同的说法。北宋苏颂在《石牧之墓志铭》中说：

　　石氏系出青社。唐季初，祖某避地徙越，因家临桂。（《苏魏公文集》卷五十五）

　　石氏南徙时间，一说是在西晋永嘉之乱时，一说是在唐初，两说均出自宋代墓志，但所述时间却相差很大，甚至还有石氏唐末避黄巢之乱，始自乐陵南徙的说法。造成这些说法迥异的原因，恐怕主要是宋代时早期的石氏谱牒已经散逸。这一点新昌石氏后裔南宋石子重在《修葺宗谱序》中说得颇为清楚：

　　石氏自万石君十五世孙建安太守渊，以晋建兴末从元年渡江，居东南。前志谓司隶校尉举为渡江祖，或谓唐末避巢寇之乱，始自乐陵徙焉。盖由谱牒散逸，遂尔舛讹。先伯祖尚书公弼始裒集墓志、家传，与史书相参叙次，谱牒于是正定。（《南明石氏宗谱》卷首）

　　经过唐末黄巢起义和五代十国战乱，唐以前的各姓家族谱牒，绝大多数都已散失不存，宋代程祁便说：“唐末五代之乱，亡失旧谱，上世次序不可复知”（《程氏世谱·序》），因此石子重的说法是可信的，符合当时的事实。

　　宋代临桂石氏修谱始于石公弼，但这时已是北宋末年。在这之前，临桂石氏后裔对自身家族历史的叙述比较混乱。而从现存石氏南宋墓志以及后世的谱牒、方志等资料来看，进入南宋以后，有关石氏来源的记载就比较统一，这可能与北宋末年石公弼修谱有关。

　　石氏到了南宋中期，甚至已有了较为完整的谱系。南宋陆游和施宿皆尝提及石氏世谱或家谱。此外，还可以举出一例，周必大《文忠集》卷七十五《循吏石大夫（昼问）墓志铭》）记载：

　　本朝秘书丞通判保州讳待举，万石四十世孙，于君为高祖，云翼军乱，扞御死之，安定胡先生为之铭。

　　墓志说石昼问高祖石待举为万石君石奋40世孙，这与现存石氏宗谱的记载若合符契；墓志写于嘉泰三年（1203），说明至迟到南宋嘉泰间，临桂石氏已有了从西汉石奋以来完整的谱系。南宋时编修的石氏谱今已无存，但推测其关于石氏来源和早期世系的核心内容应与现存石氏宗谱的记载相同。换言之，现存石氏宗谱中有关石氏来源和宋代以前早期世系的核心内容实承袭了南宋谱的记载。

　　魏晋南北朝时期（196－589）是中国历史上动荡混乱的时期，也是人口迁徙、民族融合比较频繁的时期。西晋惠帝时（291－306）发生了“八王之乱”，兵连祸结，北方中原人民遭受极大的灾难，同时西晋王朝的统治力量也大为削弱。此时匈奴刘渊、羯人石勒等胡人趋机以反晋为号召起兵，史称“五胡乱华”。永嘉五年（311），石勒在苦县（今河南鹿邑）歼灭晋军主力20万，接着刘曜、王弥等攻陷洛阳，杀官吏、士民3万余人，把晋怀帝掳到平阳（今山西临汾），这就是历史上有名的“永嘉之乱”。5年后长安也失守，存在了38年的西晋遂告灭亡，晋室南渡，司马睿称帝建邺（今江苏南京），史称东晋。为了躲避胡族统治者的屠杀，北方士族豪门和大量普通百姓源源不断地过江，逃往比较安定的长江以南。《晋书·王导传》说：“洛京倾覆，中州士女避乱江左（即江东，指长江下游以东地区）者十六七”，南迁的人超过了半数。在这一时期，原居山东乐陵的石氏家族开始向江东地区迁徙，是完全可能的。此时流向江东的中原世族，起初大多侨寓京口、丹阳（即今镇江一带）以及建邺（今南京）等地。

　　据临桂《南明石氏宗谱》记载，建兴末年（317），石氏十五世建安太守石渊（《石延庆墓志》中作石举）从晋元帝司马睿渡江，居丹阳（今江苏镇江一带），子孙分布江左。石渊一支南北朝时，其后人又向今浙江绍兴地区迁徙。此支石氏到唐代时居剡东上冈（今嵊州市浦口镇上江村），唐开成二年（837），石氏三十五世石元遂又由上冈迁居五山乡石牛镇（今新昌县城西门外）。咸通元年（860），裘甫起义，破县，石元遂避乱移家黄坛，卒葬附近平顶山。临桂石氏由此而繁衍。

石琚从安徽寿县迁徙到福建同安父子于后唐明宗天成四年(929)迁居福建，闽中始有石姓。初居苎溪(今厦门同安境内)，后其裔孙迁泉州高浦西安乡，传70余年，到四代孙元教迁居泉州镇海卫。子孙又迁漳州、福州及浙江省等地。宋仁宗皇佑年间，石氏一门七进士三尚书，在泉州建有高浦祠堂石氏家书庙。其门联：宗室尚书庙；银同甲族家。在漳州城总爷后街有司勋石公祠，泉州内井亭巷建有石氏吏部书庙。