有史以来最大的人类家谱:2700万祖先
牛津大学大数据研究所的研究人员在 探索 人类之间的遗传关系方面迈出了重要的一步:一个追踪我们所有祖先的家谱。这项研究发表在今天的《科学》杂志上。
在过去的二十年中,人类基因研究取得了非凡的进步,为数十万人产生了基因组数据,其中包括来自数千名史前人类的基因组数据。这就为追踪人类遗传多样性的起源,以生成世界各地个体如何相互关联的完整地图的可能性提供了依据。 到目前为止,这一愿景面临的主要挑战是找到一种方法来组合来自许多不同数据库的基因组序列,并开发算法来处理这种规模的数据。
然而,牛津大学大数据研究所的研究人员今天发表的一种新方法可以轻松组合来自多个来源的数据,并进行扩展以适应数百万个基因组序列。 大数据研究所的进化遗传学家、主要作者之一Yyan Wong博士解释说:"我们基本上已经建立了一个巨大的家谱,一个全人类的家谱,它尽可能地模拟了产生我们今天在人类中发现的所有遗传变异的 历史 。这个家谱使我们能够看到每个人的基因序列如何与其它基因组相关联。 由于单个基因组区域仅从父母一方(母亲或父亲)遗传,因此基因组上每个点的祖先都可以被认为是一棵树。这组树被称为"树序列"或"祖先重组图",将遗传区域与遗传变异首次出现的祖先联系起来。
主要作者Anthony Wilder Wohns博士在大数据研究所攻读博士学位,现在是麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的博士后研究员,他说:"从本质上讲,我们正在重建我们祖先的基因组,并利用它们形成了一个庞大的关系网络。然后,我们可以估计这些祖先居住的时间和地点。我们方法的强大之处在于,它对基础数据做出的假设很少,还可以包括现代和古代的DNA样本。
该研究整合了来自八个不同数据库的现代和古代人类基因组数据,共包括来自215个人群的3609个个体基因组序列。古代基因组包括在世界各地发现的样本,年龄从1000多岁到10万多岁不等。这些算法预测了进化树中必须存在共同祖先的位置,以解释遗传变异的模式。由此产生的网络包含近2700万祖先。 在这些样本基因组上添加位置数据后,作者使用该网络来估计预测共同祖先居住的位置。结果成功地重新捕捉了人类进化史上的关键事件,包括从非洲迁出。
虽然家谱图已经是一个非常丰富的资源,但研究小组计划通过继续整合遗传数据来使其更加全面。由于树序列以高效的方式存储数据,因此数据集可以轻松容纳数百万个额外的基因组。 Wong博士说:"这项研究正在为下一代DNA测序奠定基础。随着来自现代和古代DNA样本的基因组序列质量的提高,这些树木将变得更加准确,我们最终将能够生成一个单一的,统一的地图,解释我们今天看到的所有人类遗传变异的下降。 Wohns博士补充说:"虽然人类是这项研究的重点,但这种方法对大多数生物都是有效的。
英国牛津大学大数据研究所研究人员在绘制人类之间的全部遗传关系图方面迈出了重要的一步:一个单一的家谱,可追溯我们所有人的祖先。有史以来最大的人类家谱创建完成,该研究24日发表在《科学》杂志上。这个人类遗传多样性的新家谱网络,以前所未有的细节揭示了世界各地的个体如何相互关联。
建立了一个巨型家谱,这是一个全人类的家谱,它尽可能准确地模拟了产生所有人类的历史。我们今天在人类身上发现的遗传变异,这个家谱使我们能够看到每个人的基因序列是如何沿着基因组的所有点相互关联的。
由于单个基因组区域仅从父母一方遗传,无论是母亲还是父亲,基因组上每个点的祖先都可被认为是一棵树。这组树被称为“树序列”或“祖先重组图”,将遗传区域通过时间与首次出现遗传变异的祖先联系起来。
从本质上讲,我们正在重建我们祖先的基因组和使用它们来形成庞大的关系网络。然后我们可估计这些祖先生活的时间和地点。这个方法的强大之处在于它对基础数据的假设很少,并且还可包括现代和古代DNA样本。
该研究整合了来自8个不同数据库的现代和古代人类基因组数据,包括来自215个人群的总共3609个个体基因组序列。古代基因组包括在世界各地发现的年龄从1000到100000岁不等的样本。算法预测了进化树中必须存在共同祖先的位置,以解释遗传变异的模式。由此产生的网络包含近2700万个祖先。
在这些样本基因组上添加位置数据后,研究人员使用该网络来估计预测的共同祖先居住的地方。结果成功地重现了人类进化史上的关键事件,包括走出非洲。研究小组计划通过继续整合可用的遗传数据,使家谱图更加全面。由于树序列以高效的方式存储数据,因此数据集可轻松容纳数百万个额外的基因组。
家谱是一种特殊的文献:
就其内容而言,是中国五千年文明史中具有平民特色的文献,记载的是同宗共祖血缘集团世系人物和事迹等方面情况的历史图籍。
家谱属珍贵的人文资料,对于历史学、 民俗学、 人口学、社会学和经济学的深入研究,均有其不可替代的独特功能。
人体之外所处环境中的任何一种物品,比如:快递包,衣物,把手,案板,垃圾桶,桌面,纸张等,还有好多东西物品,能看到的,要使用的,应该都是!
说实话,看到这个问题我个人很气愤,我是四川的目前在成都工作。现在官方都没有公开这个问题,为了吸引流量值得嘛。这个问题能不能之后再讨论呢,天天吃饱了撑着就别吃,节约粮食。自己做好防护,静静地待着不香吗。知道来源于哪里你又能咋样喃,事情已经出现,能不能为处境里的人想想嘛,该团结的时候非得拿个键盘出来敲,消停一哈会少块肉嘛。我不怕喷,我们天天最不希望的就是看到严重了,工作的忙碌可以让我们暂时忘了恐惧,有人非得发网上了讨论,要研究去前线嘛,瞎逼逼有啥子用嘛。
“新发地检测出的病毒比现在欧洲流行的病毒更老”,如何理解?更严谨一点的说法,新发地市场检出的新冠病毒与欧洲目前流行的病毒具有相同的祖先,只不过相对老一些。也就是说,新发地的新冠病毒是目前欧洲流行的某些病毒的旁系祖先。新发地新冠病毒在进化树上的位置
我们知道,疫情爆发以来,全世界很多科学家都将检出的病毒进行基因测序,并将这些序列上传到全球共享的公共平台上供科学家研究所需。目前,已经有超过40000个新冠病毒全基因序列被上传,科学家们已经建立庞大的新冠病毒进化树。这样,每发现的一个新病毒,根据所谓最大似然性原理,就是看长得跟谁们更像,都可以在进化树上找到相应的分枝位置。
这就跟我们建立的家谱、族谱一个意思。只不过,新冠病毒的族谱是基于其基因序列的更科学的族谱。我国疾病预防控制中心目前已经将3个病毒全基因组上传到了国际开放平台Nextstrain上。这3个病毒分别来自2个感染者体内和一份环境采集标本。经过基因组比对,科学家发现这3个新冠病毒基因组在进化树上属于20B进化枝。
有史以来最大的人类家谱:2700万祖先
本文2023-10-25 04:55:43发表“资讯”栏目。
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