实际上，孔姓本身就是一个十分古老的姓氏，他们的祖先，可以远远地追溯到4400多年以前的帝喾高辛氏。帝喾是黄帝的孙子，曾经继黄帝及其父少昊之后，领导中华民族70年，因此孔姓的人，当然也是黄帝的后裔。

关于孔姓的来源，《广韵》上面有这样的记载：“殷汤之后，本自帝喾次妃兰狄吞乙卵生契，赐姓子氏；至成汤以其祖吞乙卵而生故名履，字太乙，后代以子加乙，始为孔氏。至宋孔父嘉，遭华父督之难，其子奔鲁，故孔子生于鲁。”

由此看来，孔姓是出自殷商的子姓，而殷商的开国之君殷汤，则是帝喾的次妃所生的儿子契的后代，殷汤为了纪念自己的祖先是吞乙卵而生，就取字为乙，传了若干代，到了春秋时代，在宋国的孔父嘉，为华督所杀，他的儿子就跑到鲁国避难，并且在鲁国定居，所以孔子才会是鲁国人。

《史记孔子世家》上面，对于孔姓的渊源，有更为详细的说明：“孔子，宋微子之后，宋襄公生弗父何，弗父何生宋父周，周生世子胜，胜生正考父，考父生孔父嘉，五世亲尽，别为公族，姓孔氏。孔父嘉生木金父，木金父生睾夷，睾夷生防叔，防叔畏华氏之逼，奔鲁。”

从这段记载，可以明显的看出，殷汤的后代以孔为姓，是始自孔父嘉。孔父嘉是春秋时代宋国的人，所以孔氏之得姓，应该也已经有了三千年的悠长历史。

《广韵》和《史记》上面对于孔姓的记载，内容大致相同，唯一的不同，是关于孔父嘉的后代奔鲁的记述：《广韵》上说，避华督之祸跑到鲁国的是孔父嘉的儿子木金父；《史记》上则说，奔鲁的是孔父嘉的孙子睾夷。实际上究竟是谁最先到鲁国开基，迄今仍众说纷纭，找不到确定的答案。

不过，无论哪一位才是鲁国孔氏的真正开山始祖，孔子之为孔父嘉的六世孙，已经是个不争之论。据考证，孔子的父亲是叔梁纥，祖父是伯夏，伯夏则是防叔之子。由此可见，孔父嘉不但是孔姓的创造人，而且的确是2000多年来举世同钦的至圣先师孔子的六世祖。

孔子以下的孔氏家谱，历2000余年如一日，把每一代子孙都记载得源源本本。因此，孔子的历代子孙究竟都做了些什么，各种史书上的记载也未曾间断过，而且交代得清清楚楚。 像这样，能够把孔氏的世系追溯得分毫不爽，岂不是孔姓的人比别姓的人幸运，而又足以自豪自傲的地方！孔，的的确确是一个尊荣无比的汉族姓氏。

孔氏历代修谱都非常严格，明天启年间修谱规定义子不能入谱，违者重究。

清康熙时修谱，规定更加详细： 孔氏子孙不仅行辈字有一定规定，即使用字亦随行辈而定，不准乱用。修谱时，如有不依规定乱取用者，必须改正，否则不得入谱。乾隆甲子修谱除继承康熙时的规定外，又提出凡“养异姓为子、赘婿冒姓、子随母嫁携来同居”者，亦不得入谱。对以上各方面，不仅各户头要认真作保证，而且还发动族人知情者履行检举之责。

在孔氏宗族中，除大宗主衍圣公主持纂修的全谱外，各户、各支派还有自己纂修的小谱或支谱。这些谱牒各具特色，保存了大量珍贵的历史资料。比如，《林前户支谱》记载了从汉至清历代皇帝对孔氏优免赋役的敕文，并收入嘉庆年间立于孔庙毓粹门下的蠲免碑文。《大宗支谱》则收入了更为详细的资料，在人名之下不仅载有字号、功名官职，还有妻妾娶自何家、其子娶何家之女、其女嫁与何家之男等内容。由于支谱所刊印数量较少，留存下来的仅有八部，它们是：《东家小谱》、《嫡系小谱》、《续修支谱》二种，《大宗支谱》二种，《林前户支谱》、《林前户重修孔子世家谱》。 凡是流寓外地的孔氏族人纂修的支谱，必须获得衍圣公的批准，加盖衍圣公府大印后才能成立。各级官府主要根据衍圣公府钤印的有无，来判断内孔与外孔，决定是否给予优免差徭及有别于齐民的特权。

世界最长家谱，涵盖孔子家族整个传承史的《孔子世家谱》以其延时之长、族系之明，纂辑之广、核查之实，体例之备、保存之全，2005年被吉尼斯世界纪录列为“世界最长家谱”。

孔氏全族之正式有谱，始于宋朝元丰甲子年间(公元1089年)，迄今已历九百余年。在此以前也有族谱，不过只收长支，不及旁系。自康熙甲子年后规定：每逢甲子大修一次，每逢甲午小修一次。所谓小修，即将三十年内孔裔的生死变迁分别填造成册作为大修的底册，亦即为大修做准备。清代康熙、乾隆甲子年(即公元1684、1744年)都曾大修。自此以后，孔氏族谱命名为《孔子世家谱》。它最后一次大修是民国十七年，在曲阜孔府组成了以七十六代衍圣公孔德成任总裁的修谱筹备处，着手全国孔氏家族的合修家谱工作，历时七年，完成了现存的从孔子至七十六代近两千五百年的108卷家谱档案。家族谱是古代谱牒的一种，它记述了家族始祖源起，受姓情况，对于研究家族，特别是人物、礼俗等均有重要意义。如《孔子世家谱》中的孔子年谱、孔子姓源考等对于研究孔子的学术思想和生平事迹就具有重要的学术价值。

《孔子世家谱》共分为四集。一集，以孔子为卷一，以孔仁玉(孔氏中兴祖)为卷二，孔氏六十户则自大宗次第为60卷，每户一卷(有的一卷又分几册)，共为62卷；二集则自孔仁玉以后流寓共为34卷，列入除六十户中兴祖流寓的孔裔；三集则自孔仁玉以前流寓共为十卷，每卷人数多少不等，列入中兴祖以前流裔的孔裔；四集则自上代失考者共为二卷，总共108卷。据《孔子世家谱》记载，孔子身后，单传者七代，自第八代起才逐渐繁衍，至第九代始有兄弟三人，传至第四十一代孔光嗣被孔末害死，篡位袭爵。十八年后，孔光嗣之子孔仁玉上书后唐明宗，孔末因而被诛，孔仁玉得以中兴孔族，后世尊之为中兴祖。孔末后裔从此被称为“伪孔”，不得入谱。北宋末年，第四十七代孔端友于高宗建炎三年，随康王南渡，定居浙江衢州，谓之南宗。其弟孔端操留守林庙，金命权袭封衍圣公，谓之北宗。实际上南宗才是孔子的长支后裔，但后来南宗未再北返。然派分南北流，其间也曾有南宗、北宗为正宗地位之争，直到明代弘治年间才由皇帝决定承认北宗为正宗。故合散为聚汇为一谱。

孔氏中兴祖孔仁玉的后裔原分为二十派，传到第五十五代时(明代洪武年间)，因子孙繁衍日多，散居各地，于是合此二十派的各支派分为六十户，迄今已有六百余年。其中原来的长支为大宗户，属孔族内嫡系后裔。其余各支为小宗户，后者各有其名，如临沂户、孟村户、道沟户等。从此以后，由历代皇帝先后钦定了按照行辈取名用字的序，从“希”字起孔家姓名为三字，中间字相同，其后一代一字，十分明确。先后字辈次序为：希言公彦承弘闻贞尚胤兴毓传继广昭宪庆凡祥令德维垂佑钦绍念显扬。其他姓氏也有行辈用字，但唯有孔、孟、颜、曾四姓用字相同，全国一律，不得含混，而唯有孔姓尤为严格，孔子后裔如不用此取名，不经更改，则不得入谱。所以，凡属孔姓，只要用行辈取名，一看便知是孔子的第几代子孙。这些孔裔与孔子的血缘关系应是一样的，只是由于以长子长孙做为主干的中心，其他支派才产生了相对的远近。

又据《孔子世家谱》记载，现在的孔子嫡系近支，指的是曲阜十二府内的孔裔，俗称“府门头的”，在这些府里，衍圣公是长房长子长孙，称为大宗。其他各府当然也有各自的长房长子长孙，称为小宗，也是该府的承袭人。如孔德成就属大宗户内第七十六代的大宗。大宗户与大宗是两个不同的概念；衍圣公府是六十户之首的大宗户。衍圣公是整个孔族的大宗，大宗有领导管辖本族的责任，即《礼记》所谓的收族除了上述的宗法组织外，他们收族的重要法门是修宗谱。通过修宗谱，达到“收宗合族”和“详老系、联疏亲、厚伦谊、严昌紊、序昭穆、备遗忘”的目的。另外，按照宗法制度，修孔子家谱时，有六种人不准入谱，即义子、赘婿、再醮带来之子，流入僧道者，干犯、流入下贱者。

孔氏每次修谱时，为使谱系完整严格并能按时完成，制定了一整套规章制度和一系列组织机构。首先在修谱前下发条规，以公元1774年修谱为例，就有34条之多；除了条规，孔氏家族还以衍圣公府的名义颁布修谱凡例、榜示、告示、祝文、誓词等；修谱时要“开馆”、“祭祖”、分发格册，严防冒认。为使重修的家谱不出差错，在收回旧谱上一份不漏，如旧谱损坏或丢失，都必向族长报实禀明叩乞。说明原因。旧谱交回时，都由家庭族长印领。另外在入谱上，还有一系列条规，为入家谱，必须写好呈请，恳准后方可入谱。在入谱上，如出现立嗣争继，冒宗乱真等问题，一律严加查办。修谱时，设立的组织机构有：鉴定监修、提调、编次、掌收、校阅、誉录、暂刊、收发、供应等。

由此可见，《孔子世家谱》所反映出来的孔族世系，既久远又复杂，枝繁叶茂，同出一源，绵延二千五百余年，但又十分细致严密，它给我们留下了一份珍贵的文化遗产，也给我们的工作有益的启示，对待所存的历史财富，不能只满足于保存，而要“身在宝山识清宝”。在此，我们把《孔子世家谱》概括地介绍给大家，以期为专家学者和同行们研究我国的人口学，社会学、民族学、经济史、宗法制度等作出一点应有的贡献

　　作为圣裔的孔氏宗族常常自称内孔或者真孔，而把同姓不同宗的孔氏称为外孔或伪孔。这里的里外、真伪，是以圣脉的流传作为对照的。

　圣裔们所强调区别的外孔，其情况大致有二，孔府档案属于私家档案，由于历代帝王对孔子后裔逐步封官加爵，官至一品，因此，孔府与皇帝关系逐渐密切，上下行文接连不断，全国各州府衙亦相继行文接洽关系。而用于孔府祭祀孔子的祀田达三十六万亩，分布在五省数百个县，因此县级政府与孔府间的关系亦非常多，再加上土地纠纷处理，更是文案复杂。孔府是一品官的衍圣公府，府内除三大公堂外，还有十大厅办事机构，各机构都有日常的工作文件，再加上祭林庙的各种帐册、府内生活的规定及帐册等，因此，资料极为丰富。

　孔子的后裔称内孔，又叫真孔，内院孔。在孔子第43代孙孔仁玉时，曾被刘末篡位，改姓叫孔末，同为孔姓但不同宗的孔末的后代叫外孔，也叫伪孔或外院孔。