有史以来最大的人类家谱:2700万祖先
牛津大学大数据研究所的研究人员在 探索 人类之间的遗传关系方面迈出了重要的一步:一个追踪我们所有祖先的家谱。这项研究发表在今天的《科学》杂志上。
在过去的二十年中,人类基因研究取得了非凡的进步,为数十万人产生了基因组数据,其中包括来自数千名史前人类的基因组数据。这就为追踪人类遗传多样性的起源,以生成世界各地个体如何相互关联的完整地图的可能性提供了依据。 到目前为止,这一愿景面临的主要挑战是找到一种方法来组合来自许多不同数据库的基因组序列,并开发算法来处理这种规模的数据。
然而,牛津大学大数据研究所的研究人员今天发表的一种新方法可以轻松组合来自多个来源的数据,并进行扩展以适应数百万个基因组序列。 大数据研究所的进化遗传学家、主要作者之一Yyan Wong博士解释说:"我们基本上已经建立了一个巨大的家谱,一个全人类的家谱,它尽可能地模拟了产生我们今天在人类中发现的所有遗传变异的 历史 。这个家谱使我们能够看到每个人的基因序列如何与其它基因组相关联。 由于单个基因组区域仅从父母一方(母亲或父亲)遗传,因此基因组上每个点的祖先都可以被认为是一棵树。这组树被称为"树序列"或"祖先重组图",将遗传区域与遗传变异首次出现的祖先联系起来。
主要作者Anthony Wilder Wohns博士在大数据研究所攻读博士学位,现在是麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的博士后研究员,他说:"从本质上讲,我们正在重建我们祖先的基因组,并利用它们形成了一个庞大的关系网络。然后,我们可以估计这些祖先居住的时间和地点。我们方法的强大之处在于,它对基础数据做出的假设很少,还可以包括现代和古代的DNA样本。
该研究整合了来自八个不同数据库的现代和古代人类基因组数据,共包括来自215个人群的3609个个体基因组序列。古代基因组包括在世界各地发现的样本,年龄从1000多岁到10万多岁不等。这些算法预测了进化树中必须存在共同祖先的位置,以解释遗传变异的模式。由此产生的网络包含近2700万祖先。 在这些样本基因组上添加位置数据后,作者使用该网络来估计预测共同祖先居住的位置。结果成功地重新捕捉了人类进化史上的关键事件,包括从非洲迁出。
虽然家谱图已经是一个非常丰富的资源,但研究小组计划通过继续整合遗传数据来使其更加全面。由于树序列以高效的方式存储数据,因此数据集可以轻松容纳数百万个额外的基因组。 Wong博士说:"这项研究正在为下一代DNA测序奠定基础。随着来自现代和古代DNA样本的基因组序列质量的提高,这些树木将变得更加准确,我们最终将能够生成一个单一的,统一的地图,解释我们今天看到的所有人类遗传变异的下降。 Wohns博士补充说:"虽然人类是这项研究的重点,但这种方法对大多数生物都是有效的。
UNIX作业系统(尤尼斯),是一个强大的多用户、多任务作业系统,支持多种处理器架构,按照作业系统的分类,属于分时作业系统,最早由KenThompson、Dennis Ritchie和Douglas McIlroy于1969年在AT&T的贝尔实验室开发。目前它的商标权由国际开放标准组织所拥有,只有符合单一UNIX规范的UNIX系统才能使用UNIX这个名称,否则只能称为类UNIX(UNIX-like)。
基本介绍 中文名 :Unix 本质 :作业系统 类型 :分时作业系统 开发 :1969年 公司 :AT&T 特点 :多用户、多任务 历史,诞生,流行,家谱,类UNIX,收费情况,UNIX标准,UNIX特性, 历史 诞生 1965年时,贝尔实验室(Bell Labs)加入一项由通用电气(General Electric)和麻省理工学院(MIT)合作的计画;该计画要建立一套多使用者、多任务、多层次(multi-user、multi-processor、multi-level)的MULTICS作业系统。直到1969年,因MULTICS计画的工作进度太慢,该计画被停了下来。当时,Ken Thompson(后被称为UNIX之父)已经有一个称为"星际旅行"的程式在GE-635的机器上跑,但是反应非常慢,正巧被他发现了一部被闲置的PDP-7(Digital的主机),Ken Thompson和Dernis Ritchie就将"星际旅行"的程式移植到PDP-7上。而这部PDP-7(如图1-1所示)就此在整个计算机历史上留下了芳名。 图1-1 PDP-7计算机 MULTICS其实是"Multiplexed Information and Computing Service"的缩写,在1970年时,那部PDP-7却只能支持两个使用者,当时,Brian Kernighan就开玩笑地称他们的系统其实是:"UNiplexed Information and Computing Service",缩写为"UNICS",后来,大家取其谐音,就称其为"UNIX"了。1970年可称为"UNIX元年"。 流行 1971年,Ken Thompson写了充分长篇的申请报告,申请到了一台PDP-11/24的机器。于是Unix第一版出来了。在一台PDP-11/24的机器上完成。这台电脑只有24KB的物理记忆体和500K磁碟空间。Unix占用了12KB的记忆体,剩下的一半记忆体可以支持两用户进行Space Travel的游戏。而著名的fork()系统调用也就是在这时出现的。 到了1973年的时候,Ken Thompson 与Dennis Ritchie感到用汇编语言做移植太过于头痛,他们想用高级语言来完成第三版,对于当时完全以汇编语言来开发程式的年代,他们的想法算是相当的疯狂。一开始他们想尝试用Fortran,可是失败了。后来他们用一个叫 BCPL (Basic Combined Programming Language)的语言开发,他们整合了BCPL形成 B语言 ,后来Dennis Ritchie觉得B语言还是不能满足要求,于是就改良了B语言,这就是今天的大名鼎鼎的 C语言 。于是,Ken Thompson 与Dennis Ritchie成功地用C语言重写了Unix的第三版核心。至此,Unix这个作业系统修改、移植相当便利,为Unix日后的普及打下了坚实的基础。而Unix和C完美地结合成为一个统一体,C与Unix很快成为世界的主导。 Unix Unix的第一篇文章 “The UNIX Time Sharing System”由Ken Thompson和Dennis Ritchie于1974年7月的 The Communications of the ACM发表。这是UNIX与外界的首次接触。结果引起了学术界的广泛兴趣并对其源码索取,所以,Unix第五版就以“仅用于教育目的”的协定,提供给各大学作为教学之用,成为当时作业系统课程中的范例教材。各大学公司开始通过Unix源码对Unix进行了各种各样的改进和扩展。于是,Unix开始广泛流行。 家谱 Unix在开发的过程中,没有任何的奖励制度和管理,从一开始在AT&T公司出现时,其是一种近似于好奇或兴趣的东西。 Unix家谱 然而,20世纪70年代,AT&T公司开始注意到Unix所带来的商业价值。公司的律师开始寻找一些手段来保护Unix,并让其成为一种商业机密。从1979年Unix的版本V7开始,Unix的许可证开始禁止大学使用Unix的源码,包括在授课中学习。 到了1980年,有两个最主要的Unix的版本线,一个是Berkeley的BSD UNIX,另一个是AT&T的Unix,在这个时候,很显然,竞争最终引发了Unix的战争。在这场战争中,好的是,软体开发人员还是能够得到Unix的源码并对其按照自己的需要和兴致进行裁剪。而不好的是,Unix开始一发不可收拾地开发不停地出现各种各样的变种。 1982年,Joy创建了Sun Microsystems公司并提供了工作站–Sun-1,运行SunOS(Solaris以之后的十年出现)。而AT&T则在随后的几年中发布了Unix System V的第一版,一个具有强大影响力的作业系统,最终造就了IBM的AIX和HP的HP-UX。 类UNIX AIX ( Advanced Interactive eXecutive )是 IBM 开发的一套UNIX作业系统。它符合Open group的UNIX 98行业标准(The Open Group UNIX 98 Base Brand),通过全面集成对32-位和64-位套用的并行运行支持,为这些套用提供了全面的可扩展性。它可以在所有的IBM ~ p系列和IBM RS/6000工作站、伺服器和大型并行超级计算机上运行。AIX的一些流行特性例如chuser、mkuser、rmuser命令以及相似的东西允许如同管理档案一样来进行用户管理。AIX级别的逻辑卷管理正逐渐被添加进各种自由的UNIX风格作业系统中。 Aix logo Solaris 是SUN公司研制的类Unix作业系统。直至2013年,Solaris的最新版为 Solaris 11。 solaris logo 早期的Solaris是由BSDUnix发展而来。这是因为升阳公司的创始人之一,比尔·乔伊(Bill Joy)来自加州大学伯克莱分校(UCBerkeley)。但是随着时间的推移,Solaris在接口上正在逐渐向System V靠拢,但至今Solaris仍旧属于私有软体。2005年6月14日,Sun公司将正在开发中的Solaris 11的原始码以CDDL许可开放,这一开放版本就是OpenSolaris。 Sun的作业系统最初叫做SunOS。SunOS 50开始,SUN的作业系统开发开始转向System V4,并且有了新的名字叫做Solaris 20。Solaris 26以后,SUN删除了版本号中的"2",因此,SunOS 510就叫做Solaris 10。Solaris的早期版本后来又被重新命名为Solaris 1x 所以"SunOS"这个词被用做专指Solaris作业系统的核心,因此Solaris被认为是由SunOS,图形化的桌面计算环境,以及它网路增强部分组成。 Solaris运行在两个平台:Intel x86及SPARC/UltraSPARC。后者是升阳工作站使用的处理器。因此,Solaris在SPARC上拥有强大的处理能力和硬体支援,同时Intel x86上的性能也正在得到改善。对这两个平台,Solaris禁止了底层平台差异,为用户提供了尽可能一样的使用体验。 HP-UX 取自 Hewlett Packard UniX ,是 惠普公司 (HP,Hewlett-Packard)以 System V为基础所研发成的类UNIX作业系统。HP-UX可以在HP的PA-RISC处理器、Intel的Itanium处理器的电脑上运行,另外过去也能用于后期的阿波罗电脑(Apollo/Domain)系统上。较早版本的HP-UX也能用于HP 9000系列200型、300型、400型的电脑系统(使用Motorola的68000处理器)上,和HP-9000系列500型电脑(使用HP专属的FOCUS处理器架构)。 HP-UX IRIX 是由矽谷图形公司( Silicon Graphics Inc ,一般用简称: SGI )以System V与BSD延伸程式为基础所发展成的UNIX作业系统,IRIX可以在SGI公司的RISC型电脑上运行,即是采行32位、64位MIPS架构的SGI工作站、伺服器。 IRIX Xenix 是一种UNIX作业系统,可在个人电脑及微型计算机上使用。该系统由 微软公司 在1979年从美国电话电报公司获得授权,为Intel处理器所开发。后来,SCO公司收购了其独家使用权,自那以后,该公司开始以SCO UNIX(亦被称作SCO OpenServer)为名发售。值得一提的是,它还能在DECPDP-11或是Apple Lisa电脑运行。它继承了UNIX的特性,Xenix具备了多人多任务的工作环境,符合 UNIX System V 的接口规格 (SVID)。 A/UX (取自Apple Unix)是 苹果电脑 (Apple Computer)公司所开发的UNIX作业系统,此作业系统可以在该公司的一些麦金塔电脑(Macintosh)上运行,最末(或说最新)的一套A/UX是在Macintosh II、Quadra及Centris等系列的电脑上运行。A/UX于1988年首次发表,最终的版本为311版,于1995年发表。A/UX至少需要一颗具有浮点运算单元及标签页式的存储器管理单元(Paged Memory Management Unit,PMMU)的68k处理器才能运行。 A/UX是以 System V 22 版为基础所发展,并且也使用System V 3(简称:SysV 3)、System V 4、BSD 42、BSD 43等的传统特色,它也遵循POSIX规范及SVID规范,不过遵循标准版本就难以支持最新的信息技术,因此在之后的第二版便开始加入TCP/IP网路功能。有传言表示有一个后续版本是以OSF/1为主要的代码基础,但却从未公开发表过,不过无从证实此版本是否真存在过。 收费情况 UNIX作业系统是 商业版 ,需要收费,价格比Microsoft Windows正版要贵一些。不过UNIX有免费版的,例如:NetBSD等类似UNIX版本。 UNIX标准 UNIX用户协会最早从20世纪80年代开始标准化工作,1984年颁布了试用标准。后来IEEE为此制定了POSIX标准(即IEEE1003标准)国际标准名称为ISO/IEC9945它通过一组最小的功能定义了在UNIX作业系统和应用程式之间兼容的语言接口。POSIX是由Richard Stallman 应IEEE的要求而提议的一个易于记忆的名称,含义是Portable OPerating System Interface(可移植作业系统接口) ,而X表明其API的传承。 UNIX特性 UNIX系统是一个多用户,多任务的分时作业系统。 UNIX的系统结构可分为三部分:作业系统核心(是UNIX系统核心管理和控制中心,在系统启动或常驻记忆体),系统调用(供程式开发者开发应用程式时调用系统组件,包括进程管理,档案管理,设备状态等),应用程式(包括各种开发工具,编译器,网路通讯处理程式等,所有应用程式都在Shell的管理和控制下为用户服务)。 UNIX系统大部分是由C语言编写的,这使得系统易读,易修改,易移植。 UNIX提供了丰富的,精心挑选的系统调用,整个系统的实现十分紧凑,简洁。 UNIX提供了功能强大的可程式的Shell语言(外壳语言)作为用户界面具有简洁,高效的特点。 UNIX系统采用树状目录结构,具有良好的安全性,保密性和可维护性。 UNIX系统采用进程对换(Swapping)的记忆体管理机制和请求调页的存储方式,实现了虚拟记忆体管理,大大提高了记忆体的使用效率。 UNIX系统提供多种通信机制,如:管道通信,软中断通信,讯息通信,共享存储器通信,信号灯通信。
模拟人生不能改变孩子的父亲。
模拟人生中的家谱系统是无法进行更改的,只能根据情节进行发展,没有更改的功能。
只能查找孩子父亲,孩子父亲在MC控制中心可以看,或者看下孩子的好友列表,父亲的那个人关系里会写,通过这个步骤就可以查到孩子的父亲。
有史以来最大的人类家谱:2700万祖先
本文2023-10-21 03:02:37发表“资讯”栏目。
本文链接:https://www.lezaizhuan.com/article/303711.html