据现在的考证，洪秀全的后裔有两个族群，一个在中国的安徽淮南，一个在日本。这两支洪秀全的后裔都被证实确实为洪秀全的后裔。

洪秀全一生共有十个孩子，据有关资料显示，其中有名有姓的子女有6个，最为著名的就是被清军俘虏的长子洪天贵福，他的结局最为悲惨，在曾国藩的大营里交代了一些他所知道的太平天国秘闻后，被凌迟处死。其他的几个儿子三子天光、四子天明，五子天佑和次女天姣都在天京城破后，受困于天京，根据当时的混乱局面来看，他们存活的几率很小。至于洪秀全其他的不知名的子女，极有可能遇害或者下落不明。

那么安徽淮南的那一支洪秀全后裔是他的哪个儿子的后代呢？

天京城破后，洪秀全已经死了，天王府其实已经很混乱了，洪秀全的几十个老婆也是跑的跑，逃的逃，根本就没人管。其中一个王妃就带着自己的幼子洪来喜逃出来天京城，他们逃到了安徽定远，王妃就改嫁给了一位姓程的人，儿子洪来喜就过继给了程姓人家，改名字为程文起。

王妃携子躲在安徽，逃过了清军的绞杀，过完了平淡的一生，她在临死前将程文起的身世之谜告诉了儿子和后代，要求他们恪守秘密，以免招来杀身之祸。程文起一直活到了1924年，死的时候68岁，他的后代一直生活在安徽淮南。1993年的时候，程文起的后人重修家谱，改姓为洪，而且这一支洪氏后人得到了洪秀全族裔的承认，并且将他们列入了《洪氏族谱》。

那么，来喜到底是洪秀全的哪个儿子呢？根据程文起的年龄来推算，他应该是洪秀全的五子洪天佑，来喜只是他的小名。洪天佑其实还有另外一个身份，他是东王杨秀清的继子，杨秀清在天京事变全族被屠杀后，洪秀全为了安抚军心，重修东王府，重继东王血脉，将自己的儿子洪天佑过继给了死去的杨秀清作为东王继承人。

安徽淮南的洪秀全后裔可以确凿，那么日本的洪秀全后裔又是从何而来呢？这就要从抗日战争说起了，1943年，广东花县官禄㘵村来了一群日本兵，他们簇拥了一位日本军官三叩九拜的来到洪氏宗祠，这位叫洪矢崎义郎的日军军官自称是洪秀全的后人，据讲他的奶奶从小教育他是洪秀全的后代，以后一定要回到中国去祭拜自己的祖先。

这位洪矢崎义郎后来还保护过花县官禄㘵村的洪氏宗祠，如果单凭这么一个故事很难确定洪矢崎义郎是洪秀全的后人，但是从他的后人最后将洪矢崎义郎骗取的洪氏先祖的画像归还洪氏宗祠来看，可以确认他们就是洪秀全的后裔。那么洪矢崎义郎到底是洪秀全的哪个儿子呢？

据国内专家考证，整合太平天国被俘降将和核心人物交代，洪秀全在临死前特意交代将最小的儿子及其部分的亲属秘密送往上海，并通过上海坐船逃亡到了日本。这些信息完全可以从某些资料上找到，那么洪矢崎义郎的说法就得到了印证。

洪秀全生于耕读世家

根据古老的洪氏世系资料编修的家谱，名为《万派朝宗》记载了从金田起义前后一直追溯远祖自江浙南迁到广东的过程------洪氏于汉魏时世居彭城下邳（今江苏邳县），西晋怀帝永嘉之乱中南迁京口（今镇江），东晋安帝时续迁新安郡遂安县（今杭州市淳安县），此后在各种战乱中，辗转经由江西婺源、福建汀州等而入广东。南宋名臣洪皓的曾孙洪璞出任福建泉州府晋江县县尉，举家迁到晋江。元末社会动荡，唯岭南较安定，洪璞的第十世孙洪贵生从福建迁往广东潮州府海阳县（古代县名）的布心(今属梅州市丰顺县丰良镇布新村）。所以洪贵生是洪氏迁入广东的始祖。洪秀全便是洪氏迁入广东后的第十六世孙，也即是迁到花县官禄布后的第六代。 洪秀全其祖先洪皓是南宋时期的名臣与当时的岳飞都是同期的反金爱国民族英雄。