请问庙里供奉的是佛教的菩萨吗？如果是，就没有问题，佛菩萨大慈大悲，祭祀家谱是孝道文化的传承，与佛法的教导是相吻合的，包括同时供奉祖先的排位也是可以的。但是为了表示对于佛菩萨和护法神的尊重，供奉家谱或者祖先排位之前，最好能请附近寺院里的僧人来做一场法会，表示虔诚，同时也超度历代列祖列宗。如果有条件最好能在庙里放一个播经机，24小时播经，供养祖先听经闻法修行

如果以后真的供奉了家谱或是祖先的牌位，供品是有要求的：

不能用动物制品，包括动物肉，皮毛之类的供奉，包括加了荤油的食物

供奉的素菜里不能加大葱，小葱，元葱，大蒜，韭菜，蒜薹这些菜，这些在佛法里称为 荤，是不净的

二者不宜比较：

1、供奉家谱是尊敬祖先的表现。供家谱的一项重要内容就是要准备供品和祭器，主要有供桌，蜡台，蜡烛，香炉，烧纸等。供品包括水果，点心，馒头，米饭，饺子等。

2、供牌位就是供祖宗的牌位，以及逝去的父母的牌位，在农村父母亲去世后的三年里，家里有一个牌位，上有父亲或母亲的生死时晨，每天上香，三顿饭烧好后先装上供了牌位自己才能吃。

1、一个家族，往往在家法族规中对家谱的收藏、保管提出严格的要求。如必须将家谱装进特制版木匣，供于祖龛之上，或藏于书室之中，不得随意乱放，以致亵渎家谱。

2、木匣不准移作他用，家谱不准鼠蚀虫蛀、污损油浸、腐败霉烂、遗失散落、私自誊录或借给外姓人观看，违者依家法处罚。如果领谱人敢于瞒众觅利、鬻谱卖宗、出卖家谱者，则视为不孝，从重惩治。

3、供家谱的一项重要内容就是要准备供品和祭器,主要有供桌,蜡台,蜡烛,香炉，烧纸等供品包括水果,点心,馒头,米饭,饺子等。一般在腊月二十八就蒸供馒头，蒸的时候还要在馒头上加上五个大枣,在供桌两边分别叠放起来,一堆五个下面三个上面对叠两个。

布置供桌，摆上鸡、鱼、肉、馒头、水果、烟、酒等供品。

点上香烛，祭祀祖先。从大年三十上午到初二早晨，连续三天，香火不断。祈求祖先保佑来年，地里五谷丰登，家人平平安安顺顺利利。

家谱：又称族谱、宗谱等。是一种以表谱形式，记载一个家族的世系繁衍及重要人物事迹的书。家谱是一种特殊的文献，就其内容而言，是中华文明史中具有平民特色的文献，记载的是同宗共祖血缘集团世系人物和事迹等方面情况的历史图籍。